Foi revelado pelo site oficial da Sunrise que Buddy Complex intitulado Buddy Complex: Kanketsuhen – Ano Sora ni Kaeru Mirai de (Buddy Complex Finale: In the Future When We Return to Those Skies) irá estrear em outubro.
A história vai girar em torno dos acontecimentos da primeira parte da série.
A primeira série terminou com a informação de que a história iria continuar, no entanto ainda não foi confirmado se este novo anime será uma segunda série anime ou terá outro formato, estando algumas fontes a afirmar que este será um especial dividido em duas partes.
A história da primeira temporada girar em torno da amizade e amadurecimento de dois meninos. Ela começa com Aoba Watase, um menino que vai para a escola em Tóquio e vive uma vida diária sem preocupações. Na cerimônia de abertura de sua escola depois das férias de verão ele vai para o campus, como de costume, mas tem um encontro casual com outro rapaz. O nome do outro garoto é Jyunyou Dio Weinberg. O encontro irá em breve alterar o destino do mundo.
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