アニメ 『フリクリ オルタナティブ 』の予告編を以下でご覧くださいザ・ピロウズの「Star Overhead」と「Spiky Seeds」に合わせ、前作のコンピレーショントレーラーをご覧いただけます。
詳細は公式サイトで公開された。
フリクリの新シーズンでは、ナオタとハルハラ・ハルコが共に冒険を共にした時から何年も経ちました。一方、銀河系ではメディカル・メカニカとフラタニティという二つの組織の間で激しい戦争が繰り広げられていました。ヒドミは、人生に驚くような出来事など何もないと信じているティーンエイジャーでしたが、ある日、ハルコという新しい教師が彼女の学校にやって来ます。間もなく、メディカル・メカニカが彼女の街を襲撃し、ヒドミは皆を救うかもしれない、自分自身の中にある秘密を発見します。その秘密を解き明かすことができるのはハルコだけです。
しかし、ハルコはなぜ地球に戻ってきたのでしょうか？ナオタに残したリッケンバッカー4001はどうなったのでしょうか？そして、人型ロボット「カンティ」はどこへ行ったのでしょうか？
2015年8月にプロダクションIGが『フリクリ』の原作権を取得し、その後ガイナックスが企画・展開した。.
2000年にDVD6枚組のOVAとして発売された。また、上田一による漫画2巻、榎戸洋司による小説3巻も出版され、榎戸洋司は後にアニメの脚本を手掛けた。.